基于线粒体D-loop区和Cyt b基因分析广西禾花鲤三个群体遗传结构

摘要

研究基于线粒体D-loop区和Cyt b基因部分序列,分析了广西全州、融水、环江三地禾花鲤(Cyprinus carpio)的遗传结构.在3个群体中共鉴定到19种D-loop与Cyt b序列的组合单倍型,总的单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(π)分别为0.916±0.010和0.008±0.004,禾花鲤线粒体DNA具有单倍型多样性高和核苷酸多样性低的特点.环江群体单倍型多样性最低,但是核苷酸多样性却最高,反映了环江群体存在最明显的谱系混杂.分子方差分析(AMOVA)显示遗传变异主要来源于群体内部(71.54％),禾花鲤三个群体间有显著的遗传分化(Fst=0.285;P<0.01).系统发育分析表明,多数样本的线粒体单倍型属于华南鲤(C.carpio rubrefusus)类型,同时三地禾花鲤中均检测到一定频率的西鲤(C.carpio carpio)或远东鲤(C.carpio haematopterus)类型的线粒体单倍型,提示禾花鲤可能受到鲤养殖品种的杂交渐渗.研究初步揭示了广西禾花鲤的种质资源现状,为禾花鲤这一地方特色"稻鱼共作"品种的选育和苗种管理提供了必要的依据.