利用全长转录本优化柞蚕基因组注释

摘要

[目的]优化柞蚕Antheraea pernyi基因组注释,更好地扩展其在比较基因组学及品种改良研究中的应用.[方法]对柞蚕进行全长转录组测序分析;经全长转录本与参考基因组比对,鉴定新基因及新转录本,并对这些新基因和新转录本进行功能注释及长链非编码RNAs (lncRNAs)预测.利用大量的蛋白质编码转录本和lncRNAs对柞蚕基因组中基因结构进行修订.最后创建矫正后的柞蚕基因组基因注释.[结果]新发现1997个蛋白编码基因和3399个lncRNA基因,分别由2402个和3574个全长转录本数据支持.发现柞蚕基因组合25021个基因,其中19825个基因是蛋白编码基因,包括7个保幼激素酸甲基转移酶基因.[结论]本研究促进了对柞蚕基因组基因注释信息的认识,为柞蚕及相关物种功能基因组及比较基因组学研究提供了很有用的数据资源.