基于线粒体COI基因的青海省44种蚤类的分子鉴定及系统发育分析

摘要

[目的]本研究应用DNA条形码技术对青海省部分蚤种进行鉴定,旨在弥补蚤类传统形态分类方法的不足.[方法]通过PCR扩增3总科6科22属44种共182头蚤类标本的线粒体COI基因片段(约600 bp)并进行测序和比对;用K2P模型计算种内及种间遗传距离;以邻接法(neighborjoining,NJ)构建系统发育树.[结果]共测得182条COI基因序列片段(GenBank登录号:MG138154-MG138335);分析可知蚤种内遗传距离0.01％ ～2.90％,种间遗传距离4％ ～ 12％,种间遗传距离显著大于种内遗传距离.系统发育树显示,同一物种的不同个体均形成高支持率的单系,种间分支很明显.[结论]本研究结果表明COI基因可以用于蚤类的快速鉴定.