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孑遗植物桫椤种群遗传变异的RAPD分析

         

摘要

应用RAPD标记分析了桫椤分布在海南尖峰岭及霸王岭,广东塘朗山、黑石顶及大西山孑遗种群的遗传变异.28个引物共检测到118个位点,其中多态位点33个,多态位点比率27.97%.Shannon多样性、Nei遗传分化和分子方差分析(AMOVA)结果一致显示尖峰岭种群遗传多样性最大,霸王岭种群次之、塘郎山种群第三,黑石顶种群第四,而大西山种群最小.种群的遗传变异主要发生在种群间;Shannon指数测出的种群间遗传多样性所占比率为79.10%(基于表型频率)和77.85%(基于基因频率),Nei基因分化系数(Gst)达80.69%,分子方差分析也表明种群分化极为显著(Φst=0.8286,P<0.001).桫椤的种内遗传多样性水平很低,种内Shannon多样性仅为0.0641(基于表型频率)和0.1124(基于基因频率),总基因多样性只有0.0770.另外,Jaccard相似性系数的UPGMA分析结果显示5个种群分为两个分支:尖峰岭种群和霸王岭种群组成一分支;黑石顶、塘郎山和大西山种群组成另一分支,并且三者中前两者的遗传关系更为密切.聚类分析结果还得到主成分分析的支持.根据桫椤种群的遗传变异特点,初步探讨了保护策略.

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