高粱全基因组生长素原初响应基因Aux/IAA的序列特征分析

摘要

生长素在生物体的生长、发育与分化过程中发挥着重要作用.Aux/IAA基因家族在生长素诱导的早期做出响应,是生长素早期应答的三大基因家族之一.采用生物信息学的方法,对高粱全基因组Aux/IAA基因进行序列特征分析表明,高粱基因组中共有25个Aux/IAA基因,分布于高粱9对染色体,在高粱第6号染色体上未发现Aux/IAA基因.序列比对与系统发生分析表明,22个(88%)高粱Aux/IAA蛋白具有4个保守结构域,19对高粱/玉米Aux/IAA蛋白、2对高粱/水稻Aux/IAA蛋白处于系统进化树的同一分支.该研究结果不仅有助于生长素信号转导通路的解析,而且可以为其他作物基因家族的研究提供参考.