青稞遗传多样性及其农艺性状与SSR标记的关联分析

摘要

利用92个SSR标记对108份青稞亲本材料进行多态性扫描,分析其遗传多样性,旨在寻找与农艺性状相关联的分子标记,为青稞杂交组合的配制及分子标记辅助育种提供依据.挑选48个多态性标记进行群体遗传结构分析,在此基础上采用Tassel 2.1 GLM (general linear model)和MLM (mixed linear model)方法进行标记与农艺性状的关联分析.共检测出156个等位变异,每个位点2～6个等位变异.供试群体的Shannon指数为0.6727～1.1368,材料间遗传相似系数为0.2250～1.0000,平均0.7585.通过群体遗传结构分析将供试材料划分成4个亚群.以GLM分析,发现12个与株高、穗长、穗粒数和分蘖数相关联的标记,对表型变异的解释率分别为11.5％～17.6％、19.4％～45.4％、15.4％～22.1％和29.2％;以MLM分析,发现8个与株高、分蘖数和小穗数相关的标记,各标记对表型变异的解释率分别为31.7％～49.8％、28.1％～37.2％、22.7％～32.7％.关联标记分布在基因组全部6个连锁群上.