2016—2018年四川地区猪流行性腹泻病毒流行病学调查与ORF3、S1部分基因序列分析

摘要

为分析四川地区猪流行性腹泻流行状况及分子遗传演化特征,对2016年6月至2018年6月收集的71份猪腹泻病例进行RT-PCR检测与相关的流行病学调查,并对其中4份阳性样品进行ORF3、S1基因的检测与序列分析.结果显示,近2年的发病高峰日分别在1月28日和2月11日,发病高峰期在12月至3月;猪场连年感染数量下降,新疫源地增加;ORF3基因可分为2个基因型,部分毒株发生少量碱基突变;从S1基因高变区段分型结果显示,2016年底至2018年初流行的PEDV毒株为GⅡ群,与目前流行的PEDV变异毒株在同一分支,同源性为92.8％ ～99.3％,碱基变异数量较大,与国内的经典疫苗株CV777亲缘关系较远,同源性为82.7％ ～87.3％,发病时期更集中,较传统PEDV有轻度后移.结果表明,四川地区规模化猪场PED发病率呈下降趋势,对于该病的防控取得初步成效.目前流行PEDV毒株有变异的趋势,为PEDV的防控奠定基础.