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家兔ATG16L1基因多态性与非特异性消化道紊乱易感性的研究

         

摘要

To study the susceptibility of ATG16L1 gene to non-specific digestive disorder ( NSDD) in rabbit, single nucleotide polymorphism ( SNP) of rabbit ATG16L1 gene was firstly detected by PCR-HRM and the associa-tion analysis of ATG16L1 gene mRNA expression in colon of fibre-deficient diet group was conducted .The results found that there was a SNP locus ( c.1482 G>A) in ATG16L1 gene and the SNP locus was associated with the sus-ceptibility to NSDD;the allele A of c.1482 G>A could increase the susceptibility (OR =1.43,95%confidence interval:1 .08-1 .91 , P <0 .05 );in recessive genetic model , the genotype AA could increase the susceptibility (OR =1.69,95%confidence interval:1.05-2.78,P <0.05);along with the increasing severity of non-specific digestive disorder,the ATG16L1 gene mRNA expression in colon was gradually increased (P <0.05);genotype AA had the lowest mRNA expression in fibre-deficient diet group ( P <0 .05 ) .These results showed that ATG16 L1 gene was associated with the genetic susceptibility to NSDD in rabbit .%为了研究家兔ATG16 L1基因对非特异性消化道紊乱的易感性,试验采用PCR-HRM 技术,首次对家兔ATG16L1基因进行单核苷酸多态性( SNP)检测,同时结合低纤维群体结肠ATG16L1基因 mRNA表达量进行关联分析。结果表明:ATG16L1基因存在1个SNP位点( c.1482 G>A)与NSDD的易感性相关联;c.1482 G>A位点A等位基因能增加NSDD的易感性(OR =1.43,95%置信区间:1.08~1.91,P <0.05);在隐性遗传模型中,AA基因型能增加NSDD的易感性(OR =1.69,95%置信区间:1.05~2.78,P <0.05);ATG16L1基因在结肠中的mRNA表达量随着炎症的加剧显著升高(P <0.05);AA基因型在整个低纤维诱导NSDD组中的表达水平最低(P <0.05)。这些结果均表明,ATG16L1基因与家兔NSDD的遗传易感性相关。

著录项

  • 来源
    《华北农学报》 |2013年第4期|234-238|共5页
  • 作者单位

    四川农业大学 动物遗传育种研究所;

    四川 成都 611130;

    四川农业大学 动物遗传育种研究所;

    四川 成都 611130;

    四川农业大学 动物遗传育种研究所;

    四川 成都 611130;

    四川农业大学 动物遗传育种研究所;

    四川 成都 611130;

    四川农业大学 动物遗传育种研究所;

    四川 成都 611130;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 兔;
  • 关键词

    非特异性消化道紊乱; ATG16L1; 多态性; 家兔;

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