卵形鲳鲹SST1基因的克隆与组织表达

摘要

为了解卵形鲳鲹(Trachinotus ovatus)SST1基因的生物学信息、胚胎发育不同时期的表达水平及其在组织中的表达和分布情况,进而探讨SST1基因可能的生理功能及作用机制.对卵形鲳鯵基因组(登录号:PRJNA574895)中的SST1基因(ID:EVM0001630)进行生物信息学分析,并对其在卵形鲳修胚胎发育的不同时期及其在幼鱼不同组织中的表达情况进行定量分析.结果 表明,卵形鲳鲹的SST1基因全长1155 bp,开放阅读框序列长1104 bp,共编码368个氨基酸,蛋白分子质量为41.42 ku,理论等电点pI为8.47,属于带正电的疏水性蛋白.SST1蛋白无信号肽序列,亚细胞定位主要于细胞质膜,属于膜蛋白,包含17个磷酸化位点,存在7个跨膜结构域,三维结构主体为7段α-螺旋并列扭曲排列成的一柱状结构.序列比对和系统进化树分析显示,卵形鲳鲹与黄尾鰤和高体鰤共聚于一个分支,氨基酸序列同一性分别为98.39％和98.37％.定量PCR分析结果表明,SST1在卵形鲳鲹胚胎发育的前13个时期微量表达,进入初孵仔期表达量迅速升高.SST1在卵形鲳鲹幼鱼不同组织中的表达量差异极显著,其中在脑组织中表达量最高,其次是卵巢和精巢,在背鳍、皮肤、肌肉等其他11个组织中的表达量相对较低.说明SST1在卵形鲳鯵神经内分泌、性腺发育及生殖细胞发生过程中可能发挥着重要作用.