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Supramolecular structures involving peptide nucleic acid.

机译:涉及肽核酸的超分子结构。

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摘要

This thesis work extends the body of knowledge on the properties of PNA/PNA and PNA/DNA duplexes into a perspective of material science and supramolecular chemistry.; Chapter I includes a detailed introduction to peptide nucleic acid and the structural analogs of PNA. A background information on the ligand-nucleic acid interactions is provided.; Chapter II covers the synthesis of backbone-modified chiral PNAs and the use of modified PNA/DNA duplexes as templates for the assembly of organic dye molecules (DiSC2(5)). This specific dye constitutes the first example of the ligand binding to mixed sequence PNA-containing hybrids. Moreover, thermodynamics and hybridization properties of modified PNA/DNA duplexes are investigated and the structural modifications on PNA/DNA duplexes are confirmed by a summarized collaborative study. Chapter III expands the formation of supramolecular structures by dye aggregates on PNA/PNA duplexes. The electrostatic contribution to the dye assembly on PNA/PNA duplexes are investigated along with a deeper discussion of PNA-ligand interactions.; Chapter IV explores the use of both backbone- and nucleobase-modified PNA/PNA duplexes in a lipid environment, presenting implications for a transmembrane supramolecular architecture involving PNA.; Finally, in Chapter V, a PNA/PNA duplex is modified at the end termini with organic donor and acceptor groups to be exploited as a model system for future charge/electron transfer studies utilizing PNA as a medium of transfer.
机译:本文的工作将有关PNA / PNA和PNA / DNA双链体性质的知识扩展到材料科学和超分子化学的角度。第一章详细介绍了肽核酸和PNA的结构类似物。提供了有关配体-核酸相互作用的背景信息。第二章介绍了骨架修饰的手性PNA的合成以及修饰的PNA / DNA双链体作为有机染料分子(DiSC 2 (5))组装的模板的用途。这种特定的染料构成了配体与混合序列含PNA杂化物结合的第一个例子。此外,研究了修饰的PNA / DNA双链体的热力学和杂交特性,并通过总结的合作研究证实了PNA / DNA双链体的结构修饰。第三章通过PNA / PNA双链体上的染料聚集体扩展了超分子结构的形成。研究了静电对PNA / PNA双链体上染料组装的影响,以及对PNA-配体相互作用的更深入讨论。第四章探讨了脂质环境中骨架和核碱基修饰的PNA / PNA双链体的使用,对涉及PNA的跨膜超分子体系结构提出了启示。最后,在第五章中,在末端用有机供体和受体基团修饰了PNA / PNA双链体,将其用作模型系统,用于将来使用PNA作为转移介质进行电荷/电子转移研究。

著录项

  • 作者

    Dilek, Isil.;

  • 作者单位

    Carnegie Mellon University.;

  • 授予单位 Carnegie Mellon University.;
  • 学科 Chemistry Biochemistry.; Chemistry Organic.; Biology Molecular.
  • 学位 Ph.D.
  • 年度 2003
  • 页码 198 p.
  • 总页数 198
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 eng
  • 中图分类 生物化学;有机化学;分子遗传学;
  • 关键词

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