TRAF6在沙门氏菌感染过程中对异噬调控的机制研究

目录

声明

第一章 前 言

1.1 课题研究背景

1.1.1 宿主细胞利用异噬防御细菌感染的研究进展

1.1.2 细菌病原体抵抗宿主异噬的研究进展

1.1.3 沙门氏菌研究概况

1.1.4 TRAF6与自噬作用研究进展

1.1.5 小结

1.2 课题研究重点

1.2.1 本课题研究的意义

1.2.2 本课题研究的技术路线

1.2.3 本课题研究的关键技术

第二章 材料与方法

2.1 实验材料

2.1.1 细胞株

2.1.2 细菌菌株

2.1.3 抗体

2.1.4 主要实验试剂

2.1.5 主要实验仪器与设备

2.2.1 细胞培养

2.2.2 细菌培养

2.2.3 细菌感染

2.2.4 沙门氏菌在宿主细胞中存活数的测量方法

2.2.5 SDS-PAGE电泳

2.2.6免疫印迹（Western Blot）

2.2.7 转录组测序实验方案

2.2.8 实时荧光定量PCR

2.2.9 统计分析

第三章 结果分析

3.1.1 TRAF6缺失导致LC3-II的积累

3.1.2 TRAF6缺失细胞中LC3的RNA水平较低

3.1.3 TRAF6缺失导致异噬流受阻

3.2.1 实验内容

3.2.2 转录组测序质量评估

3.2.3 差异表达基因筛选

3.2.4 通过 qRT-PCR 验证沙门氏菌感染野生细胞与 Traf6-/-细胞 RNA-Seq的可靠性

3.2.5 差异表达基因KEGG富集分析

3.3 差异基因的蛋白表达水平检测和转录水平检测

3.3.1 REDD1和c-JUN不参与TRAF6调控的细胞异噬

3.3.2 DEPTOR、FOXO3和LAMP1参与了TRAF6调控的细胞异噬

3.4.1实验内容

3.4.2实验结果

第四章 讨 论

第五章 本课题的创新之处

参考文献

发表论文及参加科研情况说明

致谢