声明
致谢
摘要
1 文献综述
1.1 研究背景
1.1.1 玉米总体概况
1.1.2 隆平206育种进展
1.2 杂种优势研究进展
1.2.1 杂种优势的定义与遗传机理
1.2.2 玉米杂种优势的应用及研究进展
1.3 水涝灾害
1.3.1 涝害对玉米产量及生长发育的影响
1.3.2 涝害对玉米生理生化的影响
1.3.3 高通量测序技术在植物响应水淹胁迫中的研究进展
1.4.1 转录组学研究方法
1.4.2 转录组学在玉米中的研究进展
2 引言
2.1 研究目的与意义
3 实验材料与方法
3.1 植物材料种植,淹水处理以及取样方法
3.1.1 供试材料与种植环境
3.1.2 淹水处理与取样方法
3.2 叶片性状测定与数据统计
3.3 叶片RNA样品的提取与纯化
3.4 RNA文库构建,文库质控与上机测序
3.4.1 RNA文库构建
3.4.2 文库质控
3.4.3 上机测序
3.5 测序数据生物信息学分析
3.5.1 测序数据及其质量控制
3.5.3 转录组文库质量评估
3.5.4 基因表达量分析
3.5.6 利用数据库对差异表达基因进行功能注释与富集分析
3.6 实时荧光定量RCR(qRT-RCR)
4 结果与分析
4.1 玉米杂交种隆平206杂种优势的转录组分析
4.1.1 隆平206及其亲本的表型分析
4.1.2 RNA提取的质量与检测
4.1.3 RNA-seq测序结果分析
4.1.4 差异表达基因的鉴定及其分类
4.1.5 qRT-PCR验证
4.1.6 隆平206与父母本之间差异表达基因的功能分类
4.1.7 隆平206与父母本之间差异表达基因的COG功能分类
4.1.8 隆平206与父母本之间的差异表达基因参与代谢调控途径分析
4.2 淹水胁迫下玉米杂交种隆平206的转录组分析
4.2.1 隆平206及水淹处理组的表型和生物量分析
4.2.2 RNA提取的质量与检测
4.2.3 RNA-seq测序结果分析
4.2.4 差异表达基因的鉴定及其分类
4.2.5 qRT-PCR验证
4.2.6 隆平206与水淹处理组之间差异表达基因的功能分类
4.2.7 隆平206与水淹处理组之间的差异表达基因参与代谢调控途径分析
4.2.8 转录因子对隆平206水淹适应性的调节
5 讨论
5.1 玉米杂交种隆平206杂种优势的转录组分析
5.1.2 碳代谢与杂种优势
5.1.3 植物激素信号转导与杂种优势
5.2 水淹条件下玉米杂交种隆平206的转录组分析
5.2.1 水淹导致隆平206体内光合作用率下降
5.2.2 水淹影响隆平206体内碳水化合物的代谢及乙醇发酵
5.2.3 AP2/ERF转录因子对于水淹条件下隆平206的低氧耐受性具有重要作用
结论
参考文献
作者简介
硕士期间发表的研究成果