线粒体异质性对应用 DNA 条形码鉴定物种和评估生物多样性的影响

目录

声明

第一章 文献综述

1.1 生物多样性，DNA条形码以及高通量测序

1.1.1 生物多样性与物种鉴定

1.1.2 DNA条形码

1.1.3 通过高通量测序技术获取完整 DNA条形码片段

1.1.4 DNA宏条形码

1.2 线粒体异质性

1.2.1 线粒体异质性概述

1.2.2 人类线粒体异质性

1.2.3 研究线粒体异质性的难点

1.3 消除(降低)Numts 对 DNA条形码影响的方法

1.3.1 线粒体 DNA富集

1.3.2 长片段扩增

1.3.3 cDNA扩增

1.3.4 生物信息学分析

1.4 榕小蜂简介

1.5 科学问题以及实验设计

第二章 材料与方法

2.1 实验材料

2.2 实验方法

2.2.1 DNA提取

2.2.2 Sanger测序以及 Miseq 高通量测序

2.2.3 数据分析

2.3 线粒体异质性验证实验

第三章 榕小蜂DNA 条形码鉴定

3.1 结果

3.2 讨论

第四章 榕小蜂线粒体异质性分析

4.1 结果

4.2 讨论

第五章 线粒体异质性对DNA条形码以及DNA宏条形码的影响

5.1 结果

5.1.1 线粒体异质性对 DNA条形码的影响

5.1.2 线粒体异质性对 DNA宏条形码的影响

5.2 讨论

第六章 线粒体异质性真实性验证

6.1 结果

6.1.1 进化选择压力分析

6.1.2 单体型特异性长片段扩增分析

6.1.3 全基因组搜索 Numts 分析

6.2 讨论

第七章 线粒体异质性分布特点

7.1 结果

7.1.1 线粒体异质性分布不存在支系特异性

7.1.2 部分物种存在雄性特异的线粒体异质性

7.2 讨论

第八章 结论

参考文献

附 录

致 谢

攻读学位期间取得的科研成果