泛癌公共驱动通路识别模型和算法研究

目录

第1章 绪论

1.1 研究背景及意义

1.2 相关知识介绍

1.2.1 泛癌数据

1.2.2 高通量测序数据库

1.3 国内外研究现状

1.3.1 识别单个驱动通路

1.3.2 识别协作驱动通路

1.3.3 识别泛癌的驱动通路

1.4 论文的研究内容与创新点

1.5 论文结构与安排

第2章 两种公共驱动通路识别模型及其求解算法

2.1 两种公共驱动通路识别模型

2.1.1 问题描述

2.1.2 识别模型MDP1和MDP2

2.2 求解识别模型的单亲遗传算法和粒子群优化算法

2.2.1 单亲遗传算法PGA-MDP1和PGA-MDP2

2.2.2 粒子群优化算法PSO-MDP1和PSO-MDP2

2.3 本章小结

第3章 实验测试与结果分析

3.1 实验数据

3.1.1 模拟数据

3.1.2 生物数据

3.2 实验环境和运行参数

3.3 模型比较

3.4 算法比较

3.5 识别性能比较

3.5.1 CB数据集

3.5.2 CBB数据集

3.5.3 CBL 数据集

3.5.4 CBLB数据集

3.6 本章小结

第4章 总结与展望

4.1 论文总结

4.2 未来工作展望

参考文献

攻读学位期间的科研和奖励情况

致谢

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