第1 章 绪论
1.1 鳄蜥概况
1.2 鳄蜥分布地点与种群数量
1.2.1 鳄蜥的分布地点
1.2.2 鳄蜥的种群数量
1.3 鳄蜥的生存现状
1.3.1 鳄蜥的野外生存环境
1.3.2 鳄蜥保护现状
1.4 鳄蜥的研究进展
1.5 爬行类动物的免疫系统研究进展
1.6 爬行动物的两大免疫基因：MHC和 TLR4基因
1.6.1 MHC基因概述
1.6.2 MHC基因研究进展
1.6.3 TLR4基因概况
1.6.4 TLR4基因研究进展概述
1.7 鳄蜥免疫基因选择 MHC与 TLR4 的原因
1.8 研究的目的和意义
1.8.1 研究目的
1.8.2 研究意义
第2 章 鳄蜥的MHC基因初步研究
2.1实验材料
2.1.1唾液采集
2.1.2 实验仪器和试剂
2.2 实验方法
2.2.1 DNA提取
2.2.2 DNA 浓度检验
2.2.3 鳄蜥基因组筛选适合扩增的 MHC基因
2.2.4 引物设计
2.2.5 PCR扩增和条带观察
2.2.6 扩增片段序列测序查看与分析
2.2.7 鳄蜥 MHC基因的命名
2.3 结果
2.3.1 鳄蜥基因组中共筛选出 3个 MHC I 与 3 个 MHCIIβ 基因用于扩增
2.3.2 最佳引物筛选结果
2.3.3 PCR扩增条带图
2.3.4 序列多态性分析
2.4 MHC基因研究小结
第3 章 鳄蜥TLR4 基因初步研究
3.1实验材料
3.1.1 唾液采集
3.1.2 实验仪器设备与试剂
3.2 实验方法
3.2.1 DNA提取与浓度检验
3.3 引物设计方法
3.4 PCR方法
3.5 数据分析与方法
3.5.1 序列测序与校对
3.5.2 鳄蜥 TLR4基因遗传多样性指数分析方法
3.5.3 鳄蜥 TLR4基因单倍型网络图构建方法
3.5.4 鳄蜥 TLR4基因 SNPs 位点分析方法
3.5.5 氨基酸替换对蛋白质影响的方法
3.6 鳄蜥 TLR4 基因研究结果
3.6.1鳄蜥TLR4基因扩增大部分LRR结构
3.6.2 鳄蜥 TLR4基因的遗传多样性参数
3.6.3 鳄蜥 TLR4基因单倍型网络图结果
3.6.4 鳄蜥 TLR4基因的 SNPs 位点分析
3.6.5 鳄蜥 TLR4突变氨基酸对蛋白质影响的预测
第4 章 讨论
4.1鳄蜥经典MHC基因缺乏核苷酸多态性
4.2 鳄蜥 MHC基因位点丧失多态性的可能原因
4.2.1近交压力大
4.2.2 物种历史上的瓶颈效应
4.2.3 病原压力单一
4.2.4 缺乏有效的基因流动
4.2.5 远古祖先的基因位点保留
4.3 鳄蜥 MHC基因缺乏核苷酸多态性将影响生存
4.3.1 抵御疾病能力下降
4.3.2 基于 MHC基因识别配偶无法进行
4.4 矛盾的人工繁育策略
4.5 鳄蜥 TLR4 基因遗传多样性指数在鳄蜥各种群间具有差异
4.6 鳄蜥 TLR4 基因单核苷酸多态性（SNPs）分布特异性显示不同的病原压力
4.7 鳄蜥 TLR4 氨基酸位点变异将影响蛋白质功能
4.8 MHC基因与 TLR基因在免疫系统相互作用
4.9 鳄蜥保护政策制定的建议
4.9.1 加强人工庇护所内家系区分
4.9.2 对鳄蜥进行全面的 MHC基因分子背景了解
4.9.3 强力的人工繁育干预
4.9.4 做好传统的保护措施
4.9.5 各保护区应结合实情制定重点保护方向
4.10 不足之处及展望
英文名词缩写词汇
参考文献
附录
攻读硕士学位期间发表论文情况
致谢
声明
广西师范大学;
