石斛DNA条形码鉴定及系统分类研究

目录

声明

摘要

引言

第一章文献研究

1．1石斛属物种鉴定研究概述

1．1．1石斛属植物资源研究现状

1．1．2石斛属种质资源鉴定技术

1．2 DNA条形码技术在石斛属物种鉴定中的研究进展概述

1．2．1 DNA条形码序列在石斛属物种鉴定中的研究进展概述

1．2．2 DNA测序技术

1．3结语

第二章石斛属叶绿体基因组研究

2．1石斛属叶绿体基因组的提取和测序

2．1．1实验材料

2．1．2实验方法

2．2石斛属叶绿体基因组DNA的提取和测序结果

2．2．1样本信息及DNA检测结果

2．2．2原始测序数据质量剪切及统计结果

2．3石斛属叶绿体基因组测序生物信息学分析

2．3．1中科4号铁皮石斛叶绿体基因组组装和注释方法

2．3．2中科4号铁皮石斛叶绿体基因组组装和注释结果

2．3．3基因功能注释分析

2．4构建石斛属叶绿体基因组DNA条形码鉴定体系

2．4．1石斛属叶绿体基因组测序数据处理及比对

2．4．2石斛属叶绿体基因组SNP和InDel分析

2．4．3群体遗传学分析

2．5结论与讨论

第三章石斛属DNA条形码筛选及验证

3．1石斛属候选DNA条形码筛选

3．1．1基于石斛属叶绿体基因组中SNP富集基因组合分析效果筛选

3．1．2基于石斛属叶绿体基因组序列信息筛选

3．2石斛属候选DNA条形码的验证

3．2．1材料与方法

3．2．2 DNA条形码验证实验结果

3．3结论与讨论

第四章结语与展望

参考文献

附录

在校期间发表论文情况

致谢