基于归纳矩阵和网络拓扑技术的micro-RNA与疾病有效关联预测

目录

声明

第一章 绪论

1.1 课题背景与意义

1.2 研究现状

1.3 本文研究内容

1.4 本文组织架构

第二章 致病 micro-RNA与多疾病有效关联相关知识

2.1 引言

2.2 Micro-RNA相关基础知识

2.3 可靠关联配对网络

2.4 可靠疾病相似度

2.5 可靠 micro-RNA相似度数据集

2.6 相关数据库

2.7 Micro-RNA与多疾病的配对作用关系

2.8 实验评价方法

第三章 基于改进归纳矩阵的 micro-RNA-疾病关联预测

3.1 引言

3.2 数据集和预处理

3.2.1 疾病与 micro-RNA关联关系作用对

3.2.2 可靠疾病相似性

3.2.3 可靠 micro-RNA 功能相似度

3.2.4 传统 K 近邻算法

3.2.5 基于加权近邻整合疾病-micro-RNA关系

3.3 基于传统归纳矩阵补全的低秩建模

3.4 IIMCMP预测算法总体架构

3.5 Micro-RNA-疾病关联预测

3.6 实验结果和分析

3.6.1 留一交叉验证

3.6.2 实验参数设置

3.6.3 评估指标

3.6.4 特定疾病案例分析

3.7 本章小结

第四章 基于网络拓扑技术的有效 micro-RNA-疾病关联预测

4.1 引言

4.2 数据获取

4.2.1 构建 micro-RNA-疾病配对有限关联网络

4.2.2 疾病网络拓扑性信息

4.2.3 Micro-RNA网络拓扑信息

4.3 预测技术模型

4.3.1 重启随机游走

4.3.2 网络推理技术

4.4 整合网络拓扑相似性结构

4.5 整合网络推理技术预测模型

4.6 实验分析与评估

4.6.1 实验结果

4.6.2 关于致病 micro-RNA-疾病有效关联的 PR曲线分析

4.7 选定疾病的案例研究

4.7.1 结肠肿瘤分析

4.7.2 前列腺肿瘤分析

4.7.3 食管肿瘤分析

4.8 本章小结

结论

参考文献

攻读硕士学位期间取得的学术成果

致谢