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主基因-多基因混合遗传的数量性状的单性状选择模型

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第一章文献综述

1.1数量遗传学的发展概况

1.1.1数量遗传学的基本概念

1.1.2数量性状的多基因学说

1.1.3数量性状的研究进展

1.1.4数量性状的数学模型

1.2主基因-多基因混合遗传模型的研究进展

1.2.1国外研究进展

1.2.2国内研究进展

1.3单性状选择理论

1.3.1影响选择效果的因素

1.3.2单性状选择方法

1.3.3选择进展

第二章主基因-多基因混合遗传分析的相关知识

2.1混合分布理论及参数估计

2.1.1混合分布的基本概念

2.1.2混合分布的似然函数

2.1.3 EM算法

2.2主基因-多基因混合遗传模型分析及参数估计

2.2.1主基因-多基因混合遗传的分布函数

2.2.2主基因-多基因混合遗传中参数的估计

2.3主基因和多基因存在的检验

2.3.1似然比检验

2.3.2主基因存在的判定

2.3.3多基因存在的检验

2.4单因素多元方差分析

2.5正态分布的极限误差

2.5.1单次测得值X的极限误差

2.5.2多次重复测量的算术平均值Xm的极限误差

2.6主基因-多基因混合遗传模型及存在的问题

2.7本文研究思路

第三章主基因-多基因混合遗传的数量性状的单性状选择模型

3.1主基因-多基因混合遗传模型简介

3.2实际样本数据的预处理及样本个体主基因型的划分

3.2.1原样本数据的预处理

3.2.2混合分布参数的估计

3.2.3观测样本个体主基因型的划分

3.3主基因-多基因混合遗传的方差分析

3.3.1方差分析模型的建立

3.3.2协方差阵的分解

3.4主基因-多基因混合遗传数量性状的单性状选择模型

第四章应用举例分析

第五章结论与讨论

参考文献

附 录

致谢

作者简介

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摘要

随着现代统计学思想在遗传学领域的渗透以及计算机的普及和发展,数量性状的主基因-多基因混合遗传模型得到了广泛的研究和应用,现已完整的研究了7类混合遗传模型。但以往的研究只是对不同动植物主基因-多基因混合遗传的数量性状的主基因和多基因存在的鉴别分析,以及遗传模型识别和各种遗传效应的分析。此外,在估计环境方差时,必须借助不分离世代(亲本P1,P2和杂交后代F1代)来估计,而且对于此类性状的选择模型从未见报道,为育种生产带来一定的不便。 主基因.多基因混合遗传的数量性状,其表型值呈现多峰性,表现为多个正态分布的混合,即对应多个主基因基因型,其选择与普通数量性状的选择在模型假定以及分析上都有很大的不同。为此,在主基因-多基因混合遗传数量性状的单性状选择中,本研究采用重复观测数据的试验设计方案,利用单因素多元方差分析方法,分别估计了主基因效应方差、多基因效应方差、环境方差,遗传力等参数,根据直接遗传进展,建立了主基因-多基因混合遗传的数量性状的单性状选择模型,为育种工作者提供一种简单易行的选择方法,具体方法如下: 首先,对单个分离世代中主基因.多基因混合遗传的数量性状进行等重复的观测,由于各次观测值及其均值的频数分布均呈现多峰性,因此利用混合分布理论来计算。为减小计算误差,本研究采用均值的频数分布来计算各成分分布的数字特征,其中成分分布个数根据AIC准则,选择使AIC值达到最小的成分分布个数作为混合分布的成分分布数,分布中其它参数的确定利用EM算法来估计;其次,每个成分分布对应一种主基因基因型,根据各个成分分布的均值和方差,利用正态分布的极限误差将每个个体划分到相应的成分分布中,即相应的主基因基因型中,将每种主基因型作为单因素方差分析的一个处理水平,对其进行单因素的多元方差分析,分别计算主基因效应协方差阵、多基因效应协方差阵、环境协方差阵等参数;最后结合混合分布中各成分分布的权重即各主基因基因型的分离比例,计算主基因效应方差,多基因效应方差和环境方差,以及遗传力等参数,进而计算该数量性状的遗传进展。这样对不同群体选择时,可直接根据遗传进展大小进行选择,且选择效率有很大提高,从而为育种者提供了极大方便。 另外,本文的原理和方法具有通用性,对有一个主基因位点或一个以上主基因位点存在的主基因.多基因混合遗传的数量性状的选择也适用。

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