使用跟种系发生相关的DNA序列证明多地区起源正确性

摘要

现有的数据表明:核酸多态性由自然选择保持在一个理想的状态。据此用千人基因组和其他一些已经发表的数据来对人类历史进行溯源。并且，研究发现人类的快变基因中有着大量的共有SNP，并且只有慢变基因中的非同义突变SNP位点(non-synonymous)才能准确、特异地研究各地区人种的生物多样性。与此同时，非洲人和其他人种分开时间应该在2.03百万年(Myr)前，第一个走出非洲的人距今应该有1.82Myr历史。研究还发现，丹尼索瓦人(Denisovans)和尼安德特人(Neanderthals)是桑人(San)和伊利比亚人(Iberians)的后代。并且，进一步的阐述了芬兰人、墨西哥人和“冰人奥茨”(Tyrolean Iceman)的来源。该研究从独有的观点阐述了现代人复杂的多地区起源。

目录

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摘要

英文缩写词简表

前言

1 数据分析

1．数据来源

1．1 丹尼索瓦人(Denisova)全基因组测序结果

1．2 尼安德特人(Neanderthal)和阿尔泰人(Altai)

1．3 提洛尔冰人(Tyrolean Iceman)

1．4 桑人(San)

1．5 澳大利亚土著(Aboriginal Australian)

1．6 千人基因组计划(1000genomes)

2．数据处理软件

2．1 PLINK

2．2 GCTA

2．3 R语言

2 数据处理结果

1．重叠位点在快变序列中富集

2．使用快变序列和慢变序列的差别

3．估算遗传分离时间

4 丹尼索瓦人、尼安德特人和澳大利亚土著人的关系

6．芬兰人(Finns)和墨西哥人(MXL)的来源

7．“冰人”奥茨属于意大利人

3 讨论

3．1 突变率、序列保守性和中性特征的关系

3．2 预期符合已知现象的结论

3．3 在人类性状特征中的新观点

4 总结

参考文献

综述 迟到半世纪对遗传等距离现象的正确解读

攻读学位期间主要的研究成果

致谢

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