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湖北省水稻纹枯病菌病毒多样性及三个与寄主毒力相关新病毒的分子特性研究

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摘要

缩略语表

第一章前言

1.水稻纹枯病及其病原

1.1水稻纹枯病的发生与危害

1.2纹枯病病原菌生物学

1.3真菌病毒研究进展

1.4本研究的目的和意义

第二章基于宏转录组测序鉴定水稻纹枯菌病毒多样性

1引言

2材料与方法

2.1研究材料

2.2纹枯菌菌株分离方法及总RNA提取和检测

2.3推定病毒RT-PCR检测方法

2.4序列比对分析及进化树构建使用软件

3结果与分析

3.1纹枯菌总RNA质量和浓度测定

3.2宏转录组测序结果分析

3.3部分病毒的聚类分析

4结论与讨论

第三章两个双分病毒的分子特性及其与寄主低毒相关性分析

1引言

2材料与方法

2.1菌株

2.2供试植物

2.3培养基

2.4试剂及引物

2.5试验方法

3结果与分析

3.1纹枯茵菌株HG81含有多条dsRNA片段

3.2 dsRNA病毒全长序列的获取

3.3RsPV3和RsPV4均是双分病毒

3.4病毒粒子形态观察

3.5RsPV3和RsPV4是两个典型的双分病毒

3.6病毒粒子转染验证病毒生物学特性

4结论与讨论

第四章单股负义链RNA病毒RsRhV1分子特性及生物学特性研究

1引言

2.1研究菌株

2.2引物

2.3研究方法

3.结果与分析

3.1 XY175菌株宏基因组测序结果分析

3.2RsRhV1全长基因组的克隆

3.3RsRhV1全长基因组特性的分析

3.4 RsRhV1基因起始和终止信号分析

3.5 RsRhV1与弹状病毒科代表属病毒基因组结构比较

3.6 RsRhV1病毒的系统进化分析

3.7 RsRhV1对寄主的生物学特性研究

3.8 RsRhV1病毒粒子的电镜观察

4讨论

4.3 RsRhV1病毒粒子的形态与已报道的弹状病毒科成员不同

4.4 RsRhV1病毒的分类地位和系统进化分析

4.5非单一病毒侵染的菌株中的其它病毒的影响

4.6 RsRhV1病毒的应用潜力

第五章结论与展望

1全文结论与讨论

1.1病毒宏转录组测序是发掘新病毒资源的有效方法

1.2来自菌株HG81中RsPV3和RsPV4病毒的研究

1.3来自XY175菌株中RsRhV1病毒特性的研究

2论文主要创新点

3研究展望

参考文献

附录

致谢

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