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柑橘黄龙病菌噬菌体遗传多样性和SOS应答转录调控因子表达特性分析

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摘要

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第一章文献综述

1.2.1症状特征

1.2.2黄龙病命名及危害

1.3黄龙病病原特征

1.3.1病原菌的分类和分布

1.3.2病原菌的流行规律

1.4HLB菌遗传多样性研究进展

1.4.1 HLB菌全基因组序列研究

1.4.2 CLas相关原噬菌体的研究

1.5细菌SOS应答机制

1.6研究的目的及意义

第二章黄龙病菌噬菌体遗传多样性研究

2.1试验材料

2.1.1试验材料

2.1.2试验试剂

2.2试验方法

2.2.1植物叶片总DNA提取

2.2.2引物设计和目的基因的扩增

2.2.3 PCR产物的回收与纯化

2.2.4目的DNA片段的连接

2.2.5重组T载体热击转化和阳性转化子鉴定

2.2.6阳性转化子的测序与分析

2.3结果与分析

2.3.1黄龙病菌阳性样品地理分布及鉴定

2.3.2黄龙病菌菌噬菌体种类鉴定结果

2.3.2黄龙病菌SC2噬菌体cthr基因遗传多态性分析

2.3.3黄龙病菌SC2噬菌体cthr基因序列特点分析

2.3.4基于黄龙病菌SC2噬菌体cthr基因的系统进化分析

2.4小结与讨论

第三章HLB菌SOS应答转录调控因子表达特性分析

3.1材料

3.1.1试验材料

3.1.2主要试剂

3.2试验方法

3.2.1引物设计

3.2.2 SOS诱导处理

3.2.3植物叶片总RNA的提取

3.2.4总RNA中DNA消化

3.2.5反转录合成cDNA

3.2.6转录调控因子RT-PCR扩增

3.2.7转录调控因子表达差异分析

3.3结果与分析

3.3.1 CLas中假定lexA基因簇的鉴定

3.3.2 MMC处理样品RT-PCR结果分析

3.3.3 UV辐射样品RT-PCR结果分析

3.3.4热处理样品RT-PCR结果分析

3.3.5 qRT-PCR引物扩增条件优化结果

3.3.6 MMC处理样品转录调控因子相关基因表达差异qRT-PCR分析

3.3.7 UV处理样品转录调控因子相关基因表达差异qRT-PCR分析

3.3.8热处理样品转录调控因子相关基因表达差异qRT-PCR分析

3.4讨论

第五章全文总结和展望

参考文献

附录

致谢

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