声明
摘要
缩略词表
1．1．1棉属的起源与进化
1．1．2我国棉花品种的改良历程及发展现状
1．2测序技术的发展
1．3基因组学的研究进展
1．3．1基因组学的发展
1．3．2基因组学对作物育种的影响
1．3．3棉花基因组学的发展
1．4植物数量性状遗传解析
1．4．1双亲衍生群体
1．4．2自然群体
1．4．3多亲本群体
1．5导入系群体
1．5．1导入系群体简介
1．5．2导入系群体的构建方法
1．5．3导入系的研究进展
1．6遗传重组的研究进展
1．6．1基于连锁作图评估重组率变异
1．6．2基于连锁不平衡作图评估群体重组率变异
1．7本研究的目的意义
2．1前言
2．2材料与方法
2．2．1实验材料与DNA的提取
2．2．2样品文库构建与测序
2．2．3变异检测与多态性分析
2．2．4种间标记的开发与验证
2．2．5导入系的构建、田间种植和性状调查
2．2．6表型数据的分析和QTL定位
2．3结果与分析
2．3．1 SNPs与InDels的鉴定分析与功能注释
2．3．2异源四倍体棉种与二倍体棉种的遗传进化分析
2．3．3种间变异为导入系遗传育种提供基础
2．3．4产量与纤维品质性状统计分析
2．3．5产量和纤维品质性状之间的相关性分析
2．3．6导入片段的分布
2．3．7产量和纤维品质相关性状的QTL定位
2．3．8候选基因的挖掘
2．4讨论
3．1前言
3．2材料与方法
3．2．1遗传图谱标记序列收集与物理图谱的构建
3．2．2标记、基因、转座子的分布与重组率的评估
3．2．3群体重测序材料收集与变异检测
3．2．4群体遗传学分析与群体重组率评估
3．2．5农艺性状的考察，全基因组关联分析与候选基因的功能验证
3．3结果与分析
3．3．1遗传图谱与物理图谱的共线性
3．3．2全基因组重组率分布与基因组特征的相关性
3．3．3高低重组区间基因的功能富集分析
3．3．4四倍体和二倍体棉种全基因组重组图谱
3．3．5种间、亚基因组间的结构变异与重组区间基因的共线性分析
3．3．6陆地棉遗传多样性：Tajima’s D与重组在地理分布和育种时期的全基因组分布模式
3．3．7农艺性状的关联分析
3．3．8重组与农艺性状之间的关系
3．4讨论
第四章总结与展望
参考文献
附录
博士期间发表的论文
致谢
