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【6h】

细胞分化的DNA复制时序和染色质三维结构的动态调控

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摘要

缩略语表

1前言

1.1全基因组复制时序图谱

1.2 DNA复制与染色质特征

1.3 DNA复制与染色质空间结构

1.4 RT和基因表达间的复杂关系

1.5研究目的以及生物学意义

2材料与方法

2.1材料

2.2数据分析方法

2.2.1数据下载

2.2.2全基因组RT分析

2.2.4 RNA-seq数据分析

2.2.5 Hi-C数据分析

2.2.6绘图和数据比较

3结果与分析

3.1不同细胞系间复制时序的差异性

3.2分化中复制域的分类

3.3.1染色质序列特征

3.3.2组蛋白修饰以及染色质开放程度

3.3.3染色质结构

3.3.4 DNA复制受染色质状态、染色质结构的协同调控

3.4基于染色质特征值的复制时序模型

4讨论

4.1转录推进染色体特定结构域的复制

4.2 RT调控染色质结构

4.3复制时序的作用

参考文献

附录

致谢

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著录项

  • 作者

    余文君;

  • 作者单位

    华中农业大学;

  • 授予单位 华中农业大学;
  • 学科 生物信息学
  • 授予学位 硕士
  • 导师姓名 李立;
  • 年度 2019
  • 页码
  • 总页数
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 中文
  • 中图分类
  • 关键词

    细胞分化; DNA复制; 时序; 染色质; 三维结构;

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