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【6h】

组蛋白修饰调控猪骨骼肌卫星细胞成肌分化机制研究

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摘要

缩略词表(ABBREVIATIONS)

1前言

1.1研究问题的由来

1.2骨骼肌发育概述

1.3骨骼肌卫星细胞研究进展

1.3.1骨骼肌卫星细胞增殖发育研究进展

1.3.2骨骼肌卫星细胞分化过程研究进展

1.3.3骨骼肌卫星细胞自我更新研究进展

1.3.4猪骨骼肌卫星细胞研究相关进展

1.4表观遗传学研究进展

1.4.1差异组蛋白修饰调节卫星细胞染色质构象

1.4.2组蛋白修饰调控卫星细胞增殖相关研究

1.4.3组蛋白修饰调控卫星细胞分化相关研究

1.5研究目的和意义

1.5.1研究目的

1.5.2研究意义

2材料与方法

2.1本研究的技术路线

2.2实验动物

2.3主要试剂和仪器

2.3.1相关试剂

2.3.2主要仪器设备

2.4实验方法

2.4.1猪骨骼肌卫星细胞分离技术

2.4.2细胞处理

2.5 RNA的提取与检测

2.5.1总RNA的提取与纯化

2.6引物设计

2.7染色质免疫共沉淀

2.8主要生物学软件和数据库

2.9转录组测序

2.9.1样品检测

2.9.2文库构建

2.10高通量数据分析

2.10.1测序数据质控

2.10.2测序数据比对及注释

2.10.4 ChIP-Seq数据结合峰分析

2.10.5 ChIP-Seq数据标准化及重复性检验

2.10.6 ChIP-Seq数据注释

2.11数据统计分析

3结果

3.1原代分离猪骨骼肌卫星细胞

3.1.1单根肌纤维法分离猪骨骼肌卫星细胞

3.1.2组织块消化法分离猪骨骼肌卫星细胞

3.2原代猪骨骼肌卫星细胞肌源性分化及鉴定

3.3原代猪骨骼肌卫星细胞后续鉴定实验

3.3.1猪骨骼肌卫星细胞复苏、传代及转染效率结果鉴定

3.3.2猪骨骼肌卫星细胞培养基更新

3.4卫星细胞总RNA质量检测结果

3.4.1总RNA提取、质检及完整性检测

3.5测序数据处理及比对结果

3.6 RNA-Seq测序分析

3.6.1转录组数据展示

3.6.2卫星细胞分化过程中差异表达基因及相关通路分析

3.7猪骨骼肌卫星细胞ChIP-Seq数据展示

3.7.1鉴定猪骨骼肌卫星细胞分化过程组蛋白修饰模式

3.7.2组蛋白修饰变化调控基因差异表达

3.7.3 H3K27me3组蛋白修饰变化对基因差异表达的调控作用

4讨论

4.1猪骨骼肌卫星细胞的分离及培养

4.2猪骨骼肌卫星细胞分化过程基因表达模式分析

4.3组蛋白修饰调控基因差异表达

4.4 H3K27me3组蛋白修饰调控卫星细胞分化能力

4.5 H3K27me3组蛋白修饰调节细胞命运

5小结

5.1本研究的主要结果

5.2本研究的创新点与特色

5.3本研究的不足与下一步工作计划

攻读学位期间撰写论文题录

参考文献

致谢

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著录项

  • 作者

    王昇;

  • 作者单位

    华中农业大学;

  • 授予单位 华中农业大学;
  • 学科 动物遗传育种与繁殖
  • 授予学位 博士
  • 导师姓名 李新云,曹建华;
  • 年度 2019
  • 页码
  • 总页数
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 中文
  • 中图分类
  • 关键词

    组蛋白; 修饰调控; 猪骨骼肌卫星细胞; 成肌分化;

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