声明
摘要
缩略词表
1前言
1.1染色质构象捕获技术
1.1.1显微成像技术
1.1.2 3C及其衍生技术
1.2染色质三维结构重构研究进展
1.2.1 Hi-C数据获得与处理
1.2.2染色质三维结构重构
1.3研究目的与意义
2材料与方法
2.1数据来源
2.2 EVRC三维结构重构算法
2.2.1数据过滤
2.2.2空间距离转化
2.2.3共聚集系数
2.2.4三维结构重构
2.2.5三维结构平滑
2.3 Cython加速
2.4算法实现
2.5算法评估
2.6在线服务平台搭建
2.6.1搭建目的
2.6.2网站架构
3结果与分析
3.1算法评估
3.1.1计算效率
3.1.2转换参数
3.1.3随机噪声
3.1.4三维结构平滑
3.2在线工具
3.3算法应用
4讨论与展望
参考文献
附录
攻读硕士期间发表的论文
致谢