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摘要
缩略词表
第一章文献综述
1．1第二代测序技术在植物基因组学研究中的应用
1．1．1第二代测序技术介绍
1．1．2第二代测序技术在植物基因组de novo测序中的应用
1．1．3第二代测序技术在植物基因组变异挖掘中的应用
1．1．4第二代测序技术在植物基因组学其他研究中的应用
1．2基于NGS技术的作物基因组分化与选择研究进展
1．3芸薹属物种基因组研究进展
1．3．1芸薹属物种的分类
1．3．2芸薹属栽培种基因组研究进展
1．4甘蓝型油菜育种历程与群体分化研究进展
1．4．1甘蓝型油菜的起源与育种历程
1．4．2甘蓝型油菜的开花习性与生态型分化研究
1．5本研究的目的和意义
第二章甘蓝型油菜基因组变异图谱和整合数据库的构建
2．1前言
2．2材料与方法
2．2．1实验材料及高通量测序
2．2．2 SNPs和InDels的鉴定与功能注释
2．2．3 SNPs和InDels的验证
2．2．4整合数据库的构建
2．3结果与分析
2．3．1 238份甘蓝型油菜的基因组重测序及数据比对
2．3．2甘蓝型油菜simple SNPs和InDels的鉴定与验证
2．3．3甘蓝型油菜simple SNPs和InDels在基因组上的分布
2．3．4甘蓝型油菜simple SNPs和InDels的功能注释
2．3．5甘蓝型油菜基因组变异数据库的构建
2．4讨论
第三章甘蓝型油菜三种生态型的遗传特征和基因组分化研究
3．1前言
3．2材料与方法
3．2．1实验材料及基因型分析
3．2．2群体遗传学分析
3．2．3基因组高度分化区域的挖掘
3．2．4 RNA-Seq和数据分析
3．2．5全基因组关联分析
3．3结果与分析
3．3．1 238份甘蓝型油菜的群体结构
3．3．2甘蓝型油菜三种生态型A和C亚基因组的非对称分化
3．3．3白菜基因组的渗入导致半冬性油菜亚基因组非对称改变
3．3．4甘蓝型油菜三种生态型的基因组高度分化区域
3．3．5春化关键调控因子FLC在甘蓝型油菜三种生态型之间的分化
3．4讨论
参考文献
附录
致谢
