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藏羊初级毛囊发育诱导期分子调控网络和候选基因转录调控机制研究

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第一章综述

1前言

2毛囊的发育及其分期

3调控毛囊发育的关键信号通路

3.1 WNT信号通路在毛囊发育中的研究进展

3.2 EDAR信号通路在毛囊发育中的研究进展

3.3 BMP信号通路在毛囊发育中的研究进展

3.4 FGF信号通路在毛囊发育中的研究进展

3.5初级毛囊发育诱导期EDAR和BMPs的互作

4非编码RNA在毛囊发育中的研究进展

4.1 miRNA在毛囊发育中的研究进展

4.2 LncRNA在毛囊发育中的研究进展

5基因的转录调控机制

5.1启动子区的转录调控

5.2 miRNA对基因的转录后调控作用

6研究目的和意义

1.1试验样品

1.2主要仪器与设备

1.3主要试剂和试剂盒

1.4主要试剂Bil$IJ

1.5细胞系和载体

1.6主要的生物信息学网站和分析软件

2试验方法

2.1皮肤形态学分析

2.2总RNA提取和cDNA合成

2.3基因组DNA的提取

2.4转录组测序和生物信息学分析

2.5 qRT-PCR

2.6切片原位杂交

2.7候选基因启动子缺失载体的构建

2.8候选基因启动子活性分析

2.9候选基因核心启动子的转录因子结合位点预测

2.10转录因子结合位点突变载体的构建

2.11转录因子结合位点突变载体的双荧光素酶活性检测

2.12转录因子超表达载体的构建

2.13核心启动子区质粒与转录因子超表达质粒共转染细胞

2.14转录因子的超表达

2.15与候选基因3’UTR结合的miRNA预测

2.16候选基因3’UTR双荧光素酶报告载体的构建

2.17候选基因3’UTR突变型双荧光素酶报告载体的构建

2.18 miRNA与候选基因结合位点的验证

2.19 miRNA对候选基因表达水平的影响

第三章结果与分析

1.1藏羊初级毛囊发育诱导期皮肤形态学分析

1.2藏羊初级毛囊发育诱导期皮肤转录组测序和生物信息学分析

1.3 qRT-PCR检测藏羊初级毛囊发育诱导期关键lncRNAs的表达水平

1.4切片原位杂交检测藏羊XLOC_297809和XLOC_764219的表达

1.5 qRT-PCR检测藏羊初级毛囊发育诱导期关键基因的表达水平

2藏羊EDAR基因的转录调控机制研究

2.1藏羊EDAR启动子区的转录调控机制

2.2 miRNA对藏羊EDAR基因表达的调控

3藏羊BMP4基因的转录调控机制研究

3.1藏羊BMP4启动子区的转录调控机制

3.2 miRNA对藏羊BMP4基因表达的调控

第四章讨论

1藏羊初级毛囊发育诱导期形态学分析

2调控藏羊初级毛囊诱导形成的关键mRNAs

3调控藏羊初级毛囊诱导形成的关键lncRNAs

4调控藏羊初级毛囊诱导形成的候选基因的选择

5候选基因的转录调控机制研究

6调控藏羊初级毛囊诱导形成的候选lncRNAs、基因、转录因子和miRNAs

1主要结论

2主要创新点

参考文献

发表论文

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