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通城猪和大白猪PRRSV感染前后外周免疫器官中差异表达LncRNA的鉴定与功能研究

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摘要

缩略词表

第一章前言

1.1研究问题的由来

1.2文献综述

1.2.1 PRRS的免疫特点

1.2.2 LncRNA的研究进展

1.2.3 PRRS抗病研究现状

1.3研究的目的和意义

2.1技术路线

2.2材料

2.2.1组织样品

2.2.2 RNA-seq测序数据与表型数据

2.2.3菌株、病毒与载体

2.2.4主要试剂与仪器

2.2.5生物信息学分析软件与网站

2.3方法

2.3.1 LncRNA的生物信息学分析

2.3.2 LncRNA的功能研究

第3章结果与分析

3.1.1 LncRNA转录本特征

3.1.2 LncRNA定量结果

3.1.3差异表达LncRNA的鉴定结果

3.1.4 PRRSV感染引起的差异表达LncRNA与差异表达mRNA共表达网络

3.1.5差异表达LncRNA的功能富集

3.1.6参与宿主对PRRSV免疫应答的LncRNA

3.2两个关健LncRNA的功能研究

3.2.1 ALDB4471抑制RSAD2表达并促进PRRSV复制

3.2.2 ALDB3437的功能

第4章讨论

4.1 LncRNA表达量存在品种间差异

4.2 LncRNA参与宿主对PRRSV免疫应答

4.3 ALDB4471可能通过结合p53抑制RSAD2表达

4.4HILPDA促进病毒复制的可能途径

第5章全文小结

5.1本研究的主要结论

5.2本研究的创新点与特色

5.3本研究的不足

5.4下一步计划

附录

参考文献

致谢

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