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【24h】

Multiplication Algorithms for Monge Matrices

机译:Monge矩阵的乘法算法

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摘要

In this paper we study algorithms for the max-plus product of Monge matrices. These algorithms use the underlying regularities of the matrices to be faster than the general multiplication algorithm, hence saving time. A non-naive solution is to iterate the SMAWK algorithm. For specific classes there are more efficient algorithms. We present a new multiplication algorithm (MMT), that is efficient for general Monge matrices and also for specific classes. The theoretical and empirical analysis shows that MMT operates in near optimal space and time. Hence we give further insight into an open problem proposed by Landau. The resulting algorithms are relevant for bio-informatics, namely because Monge matrices occur in string alignment problems.
机译:在本文中,我们研究了Monge矩阵的最大乘积的算法。这些算法使用矩阵的基本规则性要快于常规乘法算法,从而节省了时间。一个非幼稚的解决方案是迭代SMAWK算法。对于特定的类,有更有效的算法。我们提出了一种新的乘法算法(MMT),该算法对于一般的Monge矩阵以及特定的类都是有效的。理论和经验分析表明,MMT在接近最佳的空间和时间运行。因此,我们可以进一步了解Landau提出的一个开放性问题。产生的算法与生物信息学有关,即因为Monge矩阵出现在字符串对齐问题中。

著录项

  • 来源
  • 会议地点 Los Cabos(MX);Los Cabos(MX)
  • 作者

    Luis M.S. Russo;

  • 作者单位

    CITI / Departamento de Informatica, Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Universidade Nova de Lisboa, Quinta da Torre, 2829-516 Caparica, Portugal,INESC-ID, Knowledge Discovery and Bioinformatics Group, R. Alves Redol, 9, 1000-029 Lisbon, Portugal;

  • 会议组织
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 eng
  • 中图分类 信息处理(信息加工);
  • 关键词

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