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Variable Genetic Operator Search for the Molecular Docking Problem

机译:可变遗传算子搜索分子对接问题

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摘要

The aim of this work is to present a new hybrid algorithm for the Molecular Docking problem: Variable Genetic Operator Search (VGOS). The proposed method combines an Evolutionary Algorithm with Variable Neighborhood Search. Experimental results show that the algorithm is able to achieve good results, in terms of energy optimization and RMSD values for several molecules when compared with previous approaches. In addition, when hybridized with the L-BFGS local search method it attains very competitive results.
机译:这项工作的目的是为分子对接问题提出一种新的混合算法:可变遗传算子搜索(VGOS)。所提出的方法结合了进化算法和可变邻域搜索。实验结果表明,与以前的方法相比,该算法能够在几个分子的能量优化和RMSD值方面取得良好的结果。此外,当与L-BFGS本地搜索方法杂交时,它会获得非常有竞争力的结果。

著录项

  • 来源
  • 会议地点 Istanbul(TR);Istanbul(TR);Istanbul(TR);Istanbul(TR);Istanbul(TR);Istanbul(TR);Istanbul(TR);Istanbul(TR)
  • 作者单位

    Laboratoire d'Informatique de Paris 6 104 avenue du President Kennedy 75016 Paris, France;

    CISUC, Informatics Engineering Department, University of Coimbra Polo II - Pinhal de Marrocos 3030-252 Coimbra, Portugal;

    INRIA Lille - Nord Europe Research Centre 40, Avenue Halley Bt.A, Park Plaza 59650 Villeneuve d'Ascq, Prance;

    INRIA Lille - Nord Europe Research Centre 40, Avenue Halley Bt.A, Park Plaza 59650 Villeneuve d'Ascq, Prance;

  • 会议组织
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 eng
  • 中图分类 程序设计、软件工程;
  • 关键词

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