家蚕RAPD-SSR-AFLP三种分子标记综合连锁图谱的整合

摘要

针对家蚕的雌完全连锁所引起的a、b 连锁亚群的整合的问题，本文利用构建的家蚕 RAPD-SSR-AFLP三种标记综合图谱以及已公布的SSR连锁图谱信息，以各连锁群上的相关SSR 标记为参照标记，就a、b 连锁亚群的整合的方法作了创新性探索。根据a、b 连锁亚群中含有相同SSR标记或含有位于同一连锁群SSR标记的特性，将获得的a、b连锁亚群中的10组连锁群分为三类，每类按不同方法进行整合，得到了10条整合的新连锁群。整合后的新连锁群的标记数和密度明显有所提高，如整合后第3连锁群与a、b亚群中的比较，标记位点分别增加了17个和41个，平均图距分别下降了5.6cM和15.6cM，最小图距分别下降了12.5cM和15.8cM。但未能将a、b连锁亚群完全整合，推测是由于标记总数还不十分充足。