Sword of Viral Metagenomics(SVM)操作方法

摘要

病毒宏基因组学是本世纪初提出的一个概念，即一个环境中所有病毒的基因组，其中最关键的就是前期的样品处理，本文介绍的操作程序积累了军事医学科学院军事兽医研究所动物病毒学及人兽共患病防控实验室病原生态学小组5年多的实际操作经验，通过多次的摸索和改进，最终形成这样的终极版本，因为该操作程序的流程图酷似一柄宝剑，小组也谐称为“Sword of Viral Metagenomics ( SVM ) ”也寄希望通过这柄宝剑能斩开病毒组的神秘面纱，犀利地进行病原生态学研究。该SVM的核心创新之处就是引入了备份和质控步骤，从而能实时监控每一步操作，充分保障整个操作的准确性，即使某一步出现了问题，也能使用备份及时挽救;另外在一系列的操作中也进行了改进，如核酸的消化、cDNA的合成、cDNA的纯化等。