甘蔗细胞色素b6-f复合体铁硫亚基(SoCYT)基因的克隆和表达分析

摘要

以甘蔗叶片总ＲNA为模板,通过ＲT-PCＲ扩增细胞色素b6-f复合体铁硫亚基基因的cDNA,采用生物信息学软件分析所克隆基因的编码蛋白特性,并用荧光定量PCＲ分析该基因的表达情况.结果表明:克隆得到的cDNA片段长度为796bp,包括1个579bp的开放阅读框,编码192个氨基酸.甘蔗与高粱CYT基因cDNA序列的同源性为94.0％,氨基酸序列同源性为99.0％;该基因推导的蛋白分子量大小为20.67KD,等电点为6.24,疏水性分值在0.50～2.11;蛋白二级结构中α-螺旋占17.19％,随机卷曲占53.12％,延伸链占21.53％,β-转角只占8.33％,GenBAnk登录号为JQ712582.实时荧光定量分析结果表明,随着甘蔗干旱胁迫时间的延长,SoCYT基因表达均呈下降的趋势,PEG与PEG加Si处理的SoCYT基因的表达量有显著差异,加硅可减缓SoCYT基因表达的下降速度和对细胞色素b6/f复合体的结构的损伤和影响.