实现PVM环境下TNT软件的并行计算

摘要

在开展生命之树重建的研究工作中,涉及海量数据,包括古生物学、形态学、分子生物学、生态学等学科领域的全证据数据,使用最大简约性、最大似然、贝叶斯等模型对这些数据进行分析,需要具有超强计算能力的计算机.普通的台式工作站、中小型机等已经不能满足计算要求.利用计算机集群开展并行计算,是目前技术条件下最经济、最稳定、最可靠的途径.在此介绍如何在LINUX集群环境下安装配置与调试PVM虚拟机,同时使用最常用的树分析软件TNT完成简单的树重建.介绍TNT软件的ptnt命令如何在PVM环境下运行,实现并行计算.