转录组分析揭示小麦碱胁迫抗性的分子基础

摘要

从普通小麦"济南177"(JN177)与长穗偃麦草的不对称体细胞杂种后代中选育出了一个耐盐碱小麦渐渗系材料山融4号(SR4),其具有较强的耐碱性,是研究碱胁迫抗性相关基因的优良材料.对两叶一心期小麦幼苗利用含100mM碱性盐(NaHCO3∶Na2CO3=9∶1,pH8.9)的1/2Hoagland培养液处理0.5或24小时,收集幼苗根部组织进行生理指标测定及RNA提取.转录组使用Illumina HiSeqTM2000测序仪测序后以小麦EST数据库为参考基因数据库进行基因注释,对每个基因对应的原始Clean Tag数做标准化处理,获得标准化的基因表达量,鉴定差异表达基因并对部分候选基因通过转基因进行了功能初步验证.