猪圆环病毒Ⅱ型广东分离株全基因的克隆和序列分析

摘要

分离了9株PCV2广东地方分离株,并进行了全基因组序列测定;与GenBank上收录的18个PCV2毒株的全基因组序列作了比较分析,这9个毒株的全基因组序列分析表明它们之间彼此同源性高,与从国内各地分离的其它毒株的同源性也较高.对这9株PCV2广东分离毒株的ORF1和ORF2基因的序列分析表明ORF2的变异程度要比ORF1的变异程度大;对PCV2的衣壳蛋白的氨基酸序列同源性比较发现了PCV2毒株间存在1个氨基酸变异区域较大的区域和2个氨基酸变异程度较小的区域,其中前两个区域与两个主要的免疫反应区域相对应;基因进化树分析表明这9个PCV2广东分离株彼此之间及国内PCV2分离株、欧洲株之间更接近,与韩国、中国台湾、日本和美洲毒株之间也比较接近,因而在选PCV2疫苗免疫时,建议尽量使用国内生产的疫苗或自制组织灭活疫苗进行免疫.