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真核生物基因组中嵌合转座子的特征分析和功能注释

摘要

真核生物基因组中转座子元件(TE)的移动常会导致嵌合转座子的产生(即某一转座子插入到基因组中现有的其它转座子元件中).利用已有的真核生物转座子数据库,来检测其中的嵌合转座子,并分析他们的特征及其在真核生物基因组中的可能作用.在11,329条转座子序列中,共检测到802个转座子插入到690个宿主转座子中.重复序列与嵌合转座子的发生有关,可能是转座子插入的热点区域.与嵌合转座子有关的基因多定位于细胞器中,结合核酸和蛋白质.这些嵌合转座子多参与代谢过程,编码与转座和整合有关重要的酶.真核生物基因组中的嵌合转座子可能与基因组的扩大负相关,同时嵌合转座子对丰富基因表达和调控的多样性具有重要意义。

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