犬神经类型SNP分子标记的初步筛查分析

摘要

目的:检测拉布拉多犬基因组DNA中与神经类型密切相关的5个基因中的8个SNP 位点,以期为拉布拉多犬神经类型的早期鉴定提供分子遗传学鉴定指标. 方法:依据中国导盲犬大连培训基地成熟的导盲犬神经类型行为学评估标准,选取典型的安静、活泼、胆小型(弱型)三种神经类型的犬为研究对象,采取静脉血,提取血细胞的基因组DNA 样本,采用PCR/测序方法和PCR-RFLP 分析法对5 个基因的8 个SNP 位点:COMT(G482A、G216A)、MOAB(T199C)、ABCB1(A985T、T3442C、377-378 insC)、GNB1L(961-962 insG)、SLC1A2(T471C)进行变异型检测,并统计分析SNP 位点的变异型与神经类型的关联度. 结果:ABCB1 基因A985T SNP 位点的T/T型在活泼型犬中所占比例显著高于胆小型,而T/A 型在胆小型犬中所占比例显著高于活泼型(P=0.018;P=0.018);COMT基因的G482A SNP 位点的G/G型在活泼型犬中所占比例显著高于胆小型(P=0.006),而G/A 型在活泼型犬中所占比例显著低于胆小型(P=0.014);COMT 基因的G216A SNP 位点的G/G 型在活泼型犬和安静型犬中所占比例显著高于胆小型(P=0.0004;P=0.005),而G/A 型在活泼型犬和安静型犬中所占比例显著低于胆小型(P=0.001;P=0.011);SLC1A2基因T471C SNP位点的T/T型在活泼型犬中所占比例显著高于胆小型(P=0.031);其余5个SNP 位点均没有发现显著性差异(P > 0.05),其中ABCB1 基因的377-378 insC 和GNB1L基因的961-962 insG 两个插入位点在所有样本中均未检测到插入的碱基. 结论:ABCB1 基因A985TSNP 位点的T/T 型和T/A 型,COMT 基因的G216A、G482A SNP 位点的G/G 型和G/A 型,SLC1A2基因T471C SNP 位点的T/T 型与拉布拉多犬神经类型具有显著相关性,可做为拉布拉多犬神经类型早期鉴定的分子遗传诊断指标,除COMT 基因的G216A、G482A SNP 位点,其他位点还需大样本确认.