VNTR分子指纹分型法在结核分枝杆菌北京基因型菌株识别中的应用

摘要

分子指纹图谱分析研究发现在结核耐药菌株的感染与传播中北京基因型菌株是主要的组成成分，约占全世界结核菌株1／4，在中国更是占了80％以上的比例[1]。由于北京基因型菌株常常与耐多药菌株的流行相关，早期识别十分重要。IS6110-RFLP分型技术被认为是结核杆菌基因型分型的金标准。它是基于基因组中IS6110插入序列的数目和位置的差异而区分不同的菌株，已经证明有较高的分辨率和重复性。但是由于其需要高质量和较多数量的DNA，操作复杂，实际应用受到一定限制。近年来发展起来的VNTR(variable Number of Tandem Repeats，数目可变串联重复单元)指纹分型法建立在多态性的基础上，是一种新型的结核菌指纹分型法，具有简单、快速、分辨率较高等特点。但是VNTR分型法与结核杆菌北京基因型菌株识别的关系还不清楚。本文应用VNTR方法对临床结核菌株进行分型，探讨VNTR分型法在北京基因型结核菌株识别中的应用，并与另一种间隔区寡核苷酸分型法(Spoligotyping)进行比较。