一种结合领域知识的药物分子生成方法

摘要

本发明涉及药物表示学习领域，具体涉及一种结合领域知识的药物分子生成方法，包括利用构象搜索算法获得分子3D构象，从而获得分子空间信息，利用分子空间信息增强分子的初始表示；利用优化后的谱聚类算法以及优化后的CH聚类评价指标获取分子的分子划分结果；根据分子的增强表示和分子划分结果，利用图卷积神经网络对其编码获得其隐空间嵌入表示，即分别为全局图表示和局部子图表示；利用互信息最大化机制优化全局图表示和局部子图表示，得到富含空间信息和子结构信息的分子表示，并应用于下游分子生成任务；本发明有助于捕捉到分子的空间和结构信息，同时能更好地服务于基于深度学习的药物发现领域相关任务。