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一种基于随机森林和序列矩阵的蛋白互作预测方法

摘要

本发明提供了一种基于随机森林和序列矩阵的蛋白互作预测方法。通过获取蛋白质序列,根据序列矩阵蛋白质编码方法,编码蛋白质正相关数据集和蛋白质负相关数据集,获取第一输出序列矩阵;根据所述第一输出矩阵执行特征提取以生成第一特征向量;根据所述第一特征向量以及蛋白互作预测模型对所述蛋白质执行互作预测,并输出预测结果。通过将序列矩阵和随机森林相结合进行蛋白互作预测模型的构建,鉴于随机森林在处理噪声和过拟合方面的优点,以及序列矩阵编码方法编码效率高、编码简单、省时的优点,从而提高了蛋白质相互作用识别的准确率,增强了蛋白相互作用预测模型的鲁棒性。

著录项

  • 公开/公告号CN115101125A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2022-09-23

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 中科合肥智慧农业协同创新研究院;

    申请/专利号CN202210808263.X

  • 申请日2022-07-07

  • 分类号G16B25/00;G16B5/00;

  • 代理机构合肥国和专利代理事务所(普通合伙);

  • 代理人张祥骞

  • 地址 230031 安徽省合肥市长丰县双凤开发区金江路32号合肥智慧农业协同创新研究院

  • 入库时间 2023-06-19 16:56:28

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2022-09-23

    公开

    发明专利申请公布

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