一种高效分子三维构象的表达方法

摘要

本发明涉及计算机辅助药物研发技术领域，具体涉及一种高效分子三维构象的表达方法，该方法包括步骤A、建立基础片段库辅助文件；步骤B、构建分子三维构象；步骤C、记录生成分子三维构象的元数据以及步骤D、元数据的压缩存储。本发明避免了显式地记录每个分子构象中各原子的三维坐标，而是记录了高效还原每个构象三维坐标的meta信息，由于meta信息的存储量要比三维构象的显式表达要小100‑1000倍，而meta数据还原三维坐标的速度要比最快的三维构象生成的算法还要快一个数量级以上。由此，该方法突破了超大规模化学分子数据库的分子三维构象的存储限制，为药物分子的三维筛选提供了有效解决手段。