КЛИЕНТ-СЕРВЕРНАЯ БАЗА ДАННЫХ ЕКОР-Moscow О ПРИРОДНЫХ ОЛИГОПЕПТИДАХ С ИНТЕРНЕТ-ДОСТУПОМ

摘要

Природные олигопептиды, содержащие от 2 до 50 аминокислотных остатков, по-видимому, являются регуляторами практически всех жизненно важных процессов. К настоящему времени известна химическая структура почти 6000 олигопептидов, выделенных из живых организмов более чем 1000 биологических видов - представителей всех биологических империй/царств. Среди них нейропептиды представляют самый большой функциональный класс, насчитывающий более 1300 природных структур. Нами проведена формализация химических, биологических и других характеристик природных олигопептидов, образующихся в результате рибосомального матричного, нерибосомального матричного или ферментативного синтеза. В результате создана база данных ЕКОР-Моксоте (Endogenous Regulatory OligoPeptides), доступная на сайте с адресом http://erop.inbi.ras.ru.газ.ги. Она предоставляет пользователю возможность осуществлять быстрый поиск олигопептидов по различным задаваемым характеристикам, а также получать суммарные статистические данные из всей совокупности информации, введенной в базу. В ней также содержатся линки, связывающие ЕКОР-Моксош с соответствующими страницами пептидно-белковой базы 5У188Рго1-ТгЕМВЬ, а также с медико-биологической библиографической базой PubMed. Одной из особенностей ЕК.ОР-Moscow является то, что в ней содержится значительное число олигопептид-ных структур, которые отсутствуют в других общедоступных базах данных. Созданная биоиифор-мационная система может служить основой для проведения классификации природных олигопептидов по их структуре, функциям и локализации, а также для создания новых лекарственных средств на основе эндогенных веществ пептидной природы.