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メタボロミクスの技術と応用

机译:代谢组学技术与应用

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摘要

メタボロミクスは,21世紀初頭にポストゲノム研究における重要戦術として出現した。 トランスクリプトームならびに,プロテオームはゲノム情報が実行される過程のメディアの流れを表現していると考えられる。 それに対して,メタボロームは,ゲノム情報の実行の結果と考えられる。 すなわち,メタボロミクスは,ゲノム情報に最も近接した高解像度表現型解析手段であり,その応用範囲はポストゲノム科学に留まらず,医療診断,病因解析,品種判別,品質予測などの多岐に及ぶ。 基幹代謝物は,当然のことながら生物間で互換性を有するので,メタボロミクスは,ゲノム情報が利用できない実用植物や実用微生物にも適用可能である。 上記のように有望技術として期待されているメタボロミクスであるが,観測対象の代謝物の化学的性質が多岐にわたるゆえに,手法の標準化が困難であり,自動化も進んでいない。 高度な解析手段として運用するためには,高い定量性が望まれるが,メタボロミクスの各ステップ(生物の育成,サンプリング,誘導体化,分離分析,データ変換,多変量解析によるマイニング)は,すべてが誤差を発生する要素を含み,標準技術の確立が極めて困難である。 当該状況が,メタボロミクスの正しい理解を困難とし,一般の研究者への普及を阻む一因となっている。 本稿では,メタボロミクスの技術を簡単に述べるとともに,種々の用途への適用可能性を提示することを目的とした(図1)。
机译:二十一世纪初,超基因组学成为后基因组研究的重要策略。转录组和蛋白质组被认为代表了基因组信息执行过程中的介质流动。另一方面,代谢组被认为是执行基因组信息的结果。换句话说,代谢组学是一种最接近基因组信息的高分辨率表型分析方法,其应用范围不仅限于后基因组科学,而且还扩展到医学诊断,病因分析,品种鉴别和质量预测等广泛领域。由于关键代谢物当然在生物体之间是相容的,因此代谢组学也可以应用于无法获得基因组信息的实用植物和微生物。如上所述,代谢组学被认为是一种有前途的技术,但是由于要观察到的代谢物的化学性质范围很广,因此很难对该方法进行标准化并且自动化尚未取得进展。希望将高定量作为一种先进的分析方法,但是代谢组学的所有步骤(生命,采样,衍生化,分离分析,数据转换,通过多变量分析进行挖掘)都是错误的。建立包括所产生元素的标准技术是极其困难的。这种情况使正确理解代谢组学变得困难,并且是阻止其传播给一般研究人员的因素之一。本文的目的是简要描述代谢组学技术,并介绍其在各种应用中的适用性(图1)。

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