ÉTUDE DE LA ROBUSTESSE DES PHYLOGÉNIES MOLÉCULAIRES

摘要

Au cours des dernières années, le nombre de macromolécules biologiques séquen-cées a augmenté très rapidement. Ceci a fourni une base de données d'une richesse considérable pouvant être exploitée tant pour la reconstruction phylogénétique que pour la compréhension des mécanismes de l'évolution à l'échelle moléculaire. Toutefois, pour extraire le maximum d'information des données moléculaires, on doit pouvoir évaluer la fiabilité des arbres phylogénétiques qu'elles fournissent. En effet, des résultats contradictoires sont souvent observés aussi bien lors de la comparaison de phylogénies moléculaires obtenues à partir de molécules différentes, que dans la comparaison des phylogénies moléculaires et des phylogénies plus classiques, utilisant des caractères morphologiques. L'unicité de l'histoire évolutive nécessite la levée de telles contradictions. Il a été choisi de le faire d'une part en mettant au point des tests de robustesse et de fiabilité des arbres, d'autre part en affinant les hypothèses biologiques des modèles de construction. La phylogénie des Métazoaires est un exemple particulièrement intéressant pour mettre en évidence certaines voies d'approche empirique de la robustesse des phylogénies moléculaires. Il est intéressant de faire varier les paramètres suivants : (ⅰ) les nucléotides ou acides aminés, (ⅱ) les espèces, (ⅲ) les méthodes de construction et (ⅳ) les tests de robustesse. De telles analyses gén╚╮ent un très grand nombre d'arbres différents et il faut pouvoir les analyser de manière critique. La nécessité d'outils informatiques performants pour gérer l'ensemble de ces données s'impose.