小黑杨bHLH转录因子基因和启动子的克隆与分析

摘要

为了研究木本植物中同源bHLH (basic helix-loop-helix)转录因子的功能,以小黑杨为研究对象,参照毛果杨序列设计引物进行PCR.获得了2条bHLH转录因子基因以及其上游部分启动子序列,将获得的基因命名为PxbHLH01和PxbHLH02,并对这2个基因进行了详细的生物信息学分析.多序列比对结果表明,与拟南芥编码bHLH转录因子UPBEAT1有较高同源性.系统进化树表明与毛果杨和拟南芥等同源基因亲缘关系较近.启动子顺式调控元件分析结果表明,其启动子区包含有氧应答及其它胁迫相关元件,其功能可能与植物活性氧代谢以及胁迫耐受相关.