杜仲EuHMGRS基因家族的鉴定及生物信息学分析

摘要

萜类物质合成关键酶3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGRS)是甲羟戊酸途径(mevalonate pathway,MVA)的第1个限速酶,对萜类物质的合成具有重要的作用.为了探明EuHMGRS家族基因对杜仲萜类物质合成的调控机制,对EuHMGRS家族基因进行生物信息学分析,结果表明:杜仲EuHMGRS基因中存在HMGRS特有的保守的活性位点,其中包括2个HMG-CoA结合位点(EMPVGYVQIP、TTEGCLVA)和2个NADP (H)结合位点(DAMGMNM、GTVGGGT),因此可以确定为杜仲HMGRS基因家族,在杜仲中该家族成员至少包含3个基因,记为EuHMGR 12、EuHMGR 18、EuHMGR19.杜仲HMGRS与其它植物的HMGRS蛋白相比在中间区域和C端保守性高,在N端的序列相似性较低,预示不同的HMGRS基因功能上具有高度的保守性,但是对于在亚细胞定位可能会具有多样性.