油茶果实发育相关基因SPATULA/ALCATRAZ的鉴别

摘要

拟南芥(Arabidopsis thaliana)SPATULA/ALCATRAZ是与果实发育和果实大小有关的基因。对普通油茶(Camellia oleifera)幼叶、未成熟种仁、花蕾的转录组数据进行挖掘,得到2条油茶SPATULA基因序列和1条油茶ALCATRAZ基因序列;从油茶基因组三代测序数据中鉴别出含有前述3条序列的基因组DNA序列;最后,得到3条油茶SPATULA/ALCATRAZ基因全长CDS序列,分别命名为CoSPT1、CoSPT2、CoALC。用基部被子植物无油樟(Amborella trichopoda)的SPATULA及核心真双子叶植物53个SPATULA/ALCATRAZ蛋白质序列构建进化树,结果表明,CoALC与拟南芥AtALC分布在不同的亚支,CoALC在油茶中的功能可能与AtALC不同,油茶蒴果的开裂机制可能与拟南芥不同;CoSPT1和CoSPT2的序列相似度只有54.57%,并且与CacuaSPT在同一个亚支,CoSPT1和CoSPT2可能是72.9~101.4百万年前Ad-β全基因组复制的产物。