HIV-1蛋白酶与抑制剂结合中桥接水分子作用的QM/MM研究

张玉新; 张少龙; 张庆刚

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HIV-1蛋白酶与抑制剂结合中桥接水分子作用的QM/MM研究

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对HIV-1蛋白酶与抑制剂2AH和4AH结合的两个复合物体系进行了水溶液环境下量子力学分子力学混合方法(hybrid QM/MM)的1ns分子动力学模拟,用MM-GBSA方法得到桥接水分子W301与HIV-1蛋白酶和抑制剂结合体的结合自由能分别为-24.93 kJ/mol和-20.29 kJ/mol,表明W301在抑制剂和HIV-1蛋白酶结合的过程中起到了不能被忽略的作用.

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来源
《山东科学》 |2010年第1期|1-5|共5页
作者
张玉新; 张少龙; 张庆刚;
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作者单位

山东师范大学物理与电子科学学院,山东,济南,250014;

山东师范大学物理与电子科学学院,山东,济南,250014;

山东师范大学物理与电子科学学院,山东,济南,250014;

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正文语种 chi
中图分类化学键的量子力学理论;
关键词
hybrid QM/MM方法; AM1方法; W301水分子; 结合自由能; MM-GBSA;

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