子宫内膜癌预后相关差异表达基因筛选及其生物信息学分析

摘要

目的 筛选子宫内膜癌(EC)预后相关的差异表达基因(DEGs),并对其进行生物信息学分析.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)收集临床病理学参数及生存资料完整的EC患者140例,与基因表达综合(GEO)数据库联合筛选DEGs.以各基因表达水平的中位数作为高低表达的截断值,通过COX回归和Kaplan-Meier曲线筛选预后相关DEGs,并比较不同临床病理参数EC患者预后相关DEGs表达水平.使用基因本体论(GO)及基因组百科全书(KEGG)对预后相关DEGs进行功能通路富集分析.结果 TCGA联合GEO数据库共筛选出5个DEGs,即ASPA、MYBL2、TROAP、CCNB2和CDC25C(P均<0.05);5个DEGs中,仅MYBL2基因高低表达EC患者总生存期和无病生存期差异有统计学意义(P均<0.05),且组织低分化、Ⅱ型EC患者MYBL2基因高表达比例分别高于高分化、Ⅰ型患者(P均<0.05).GO功能富集分析结果显示,MYBL2基因在生物学过程层面主要参与细胞代谢、生物调节等过程,在细胞组成层面主要参与细胞膜、细胞核、大分子复合物等的形成,在分子功能层面主要参与蛋白结合、核酸结合、核苷酸结合等.KEGG通路分析结果显示,MYBL2基因与癌症途径、癌症的蛋白聚糖、细胞周期、细胞凋亡和人类T淋巴病毒感染通路有关(P均<0.05).结论 成功筛选出EC预后相关DEGs为MYBL2,该基因通过多种途径参与EC的发生发展过程,可作为EC治疗的分子靶标和诊断生物标志物.